Der FC Wacker Innsbruck wurde am 21. Juni 2002 mit dem Namen "FC Tirol" gegründet. Als eine Art inoffizieller Nachfolger des vorherigen, nach finanziellen Malversationen in Konkurs gegangenen FC Wacker Tirol. Über eine Spielgemeinschaft mit Wattens schaffte man 2003 den direkten Aufstieg in die zweite Spielklasse, 2004 bis 2008 spielte der FC Wacker Innsbruck in der Bundesliga, ebenso von 2010 bis 2014.
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